; 據中國水稻研究所副研究員李春生介紹，在現代水稻育種史上，20世紀50年代末至60年代初的水稻品種矮稈化和70年代的雜交水稻三系配套是兩個重要里程碑。這兩次重大突破為水稻改良奠定了基礎。目前，常規水稻育種已經達到頂峰。基因技術在水稻育種上的應用，將是水稻育種的第三次突破。世界各國尤其是發達國家非常重視基因技術在作物育種方面的應用，大型種業企業都競相開展轉基因育種研究。
;“民以食為天，農以種為先”。為了達到增產的目的，利用水稻亞種間雜交優勢培育超高產品種是現階段主攻方向。中國的雜交水稻是高產育種的代表。但是，水稻產量除了與品種的內在基因有關外，還受地理環境、氣候及病蟲害等因素影響。現代水稻育種目標呈現多元化。除了高產育種外，還有抗病蟲育種、抗旱育種、抗澇育種、耐鹽育種、品質改良和功能稻育種等。
; 病蟲害是水稻減產的重要原因，比如，稻瘟病菌就可以致使水稻大幅減產甚至絕產。為解決這一問題，通過轉入有效基因來控制水稻病蟲害是研究方向之一。國際水稻研究所已通過分子標記輔助選擇將4種不同抗稻瘟病基因累加到同一水稻品種，獲得了廣譜抗稻瘟病材料，不久將實現這種抗病轉基因稻應用于生產的目標。美國研究人員發現一種酵母信息素可以阻止稻瘟病菌感染水稻植株。通過基因工程技術將能夠培育出含信息素的植株，并推廣應用。美國康乃爾大學研究人員則從馬鈴薯中分離出一種基因，這種基因能誘導水稻產生干擾害蟲消化過程的蛋白，進而抑制害蟲的食欲，降低蟲害損失。這一成果為開發新型抗蟲轉基因水稻奠定了基礎。預計，數年后轉基因抗蟲害的水稻新品種將可以推廣應用，這不僅有助于增加水稻的產量，也可減少農藥的使用，改善農田生態環境。
總之，近代高新生物技術尤其是轉基因技術的發展，為水稻育種提供了廣闊天地和無限遐想，使之不斷創造出奇跡。